При загрузке из текстового файла формируется документ РТиУ и подчиненный СчетФактура.
В документе РТиУ заполняются табличные части Товары и ВидыЗапасов.
Реквизит шапки ВидыЗапасовУказаныВручную = Истина.
Причем в отладчике видно, что реквизит НомерГТД заполняется корректно.
В загруженном документе, если вызвать команду "Еще"->"Виды запасов" колонка "Номер ГТД" пустая.
Но при этом через универсальную форму просмотра видно, что НомерГТД заполнен.
А при проведении колонка НомерГТД очищается.
Соответственно, в печатной форме УПД номер ГТД и страна - пустые.

Пните в нужном направлении, что еще не так записывается, за выходные голову сломал уже.

банально - сравни два документа, один "хороший", другой твой

если не поймешь разницу - в отладчик

(0) виды запасов не стоит загружать, при записи/проведении документа их построит сам документ

Как вариант хранить загруженные гтд в отдельной тч
и делать постобработку видов запасов после их заполнения в типовом методе (через расширение)
но только если уверен в наличии данных гтд по данным товарам

может просто галка ВестиУчетПоГТД в товаре не стоит?

(5) Галка стоит.

(4) УПД формируются в другой программе и оттуда делается экспорт с теми ГТД, которые должны быть в этом документе. Сюда надо загрузить так, чтобы НомерГТД соответствовал уже сформированным документам.

(3) Не надо чтобы их строил документ, надо чтобы они соответствовали уже сформированным в другой базе.

(8) бред

(9) Нисколько не умаляю ваш опыт и компетенцию, но в данном случае ваше высказывание голословное.

в какой-то версии УТ глюк был, мы патчили, Перед записью в модуле РТУ добавляли
Если РежимЗаписи = РежимЗаписиДокумента.Проведение и Не ВидыЗапасовУказаныВручную Тогда
Если РежимЗаписи = РежимЗаписиДокумента.Проведение Тогда
  ЗаполнитьВидыЗапасов(Отказ);