Сейчас установлено SQL Server 2000 и Windows 2003 Server.

Переходим на 8.2 так как, поддержка нашей конфигурации на 8.1 закончилась, текущее обновление только на 8.2.
Мне посоветовали что для 8.2 с 2000 SQL точно нужно переходить.

Прочитал много тем тут, многие рекомендуют переходить сразу на SQL Server 2008.

Есть несколько вопросов:
1. Какой все таки поставить SQL Server 2005 или 2008? Если 2008 то какую редакцию, а то я уже в них запутался.
2. Будет ли SQL Server 2008 нормально работать на Windows 2003 Server?
3. Имеет ли смысл ставить 64-разрядную систему? Я с этим вообще не сталкивался, ничего не знаю.

(0) >> ничего не знаю.

Пригласите специалиста (с) не моё

Системные требования 1С: http://v8.1c.ru/requirements/

SQL Server 2000:
- рекомендуется установка пакета обновлений 4 (SP4),
- требуется установка пакета обновлений 2 (SP2),
- рекомендуется использовать SQL Server 2005 и выше

(1) Спасибо, как раз то что нужно