Для фоновых заданий, как объектов 1с, есть метод ОжидатьЗавершения.
Если фоновое задание "подвисает", то следующее не запускается. При возникновении ошибок количество перезапусков определяется настройками "Количество повторов при аварийном завершении" и "Интервал повтора при аварийном завершении".
Можно отлаживать фоновые задания для этого сервер 1С:Предприятие должен быть запущен в режиме отладки (директива -debug см. google) и в отладка - подключение - автоматическое подключение - галочка "фоновые задания"