Предположим, я сделаю такую вещь - добавлю в базу SQL ещё одну (две) filegroups и перекину в них отдельные таблицы базы.
Как 1с к этому отнесётся? При работе и при реструктуризации?

Вот на хабрахабре  какой-нибудь отщепенец сначала бы поставил эксперимент, написал бы копростатью и выложил бы ее туда чтобы потом хвастаться перед знакомыми... Миста не такая...

:)

(1) Я это сделаю :-) В смысле - перенесу, а не статью напишу... Просто заранее хотелось бы понять, сколько бочек бизнес-геля мне понадобится...

не-не.. эксперимент означает что ты не возьмешь свою терабайтную продакшен базу. А маленькую демо-базу например УНФ  или УТ11

а вдруг уже кто-то делал? :-)

Я делал.
1цэ знает только имя базы на сервере, и как ты там базу разложишь, ей фиолетово...

(6) Главный вопрос - про реструктуризацию и обновление... Не станет ли оно перетаскивать таблицы обратно? Как оно первичный ключ обновляет?

Если реструктуризация не затрагивает перенесённые таблицы, то ничего с ними и не будет. Ну, а в противном случае 1цэ создаёт копию таблицы, переливает в неё данные, старую удаляет, а новую переименовывает.

мдя... То есть после оной придётся заново переносить... Ну и на том спасибо :-)