Подскажите сформировал баланс за 2013 год по строке 337(показатель уменьшения балансовой стоимости ОЦИ*) на начало года сумма 0,но если посмотреть баланс за 2012 год то по строке 337 на конец года был остаток!Так и должно быть?

естественно, нет.
валюта баланса не должна меняться. с какого перепугу?

просто раньше по этой строке отражались, как положено, данные из балансовых счетов - 101 и 104.

а теперь вдруг методисты 1С рухнули с дуба, придумали свой особенный забалансовый счет ОЦИ  и в баланс берут сальдо по этому забалансовому счету.
Само словосочетание - что Баланс строится на основе данных  ЗАбалансовых счетов - лично меня ввергает в легкий ступор.
это в чистом виде самодеятельность методистов 1С.

ну а у тебя решение простое - разумеется, надо, чобы на счете ОЦИ появилось сальдо на начало года. (хотя сам счет появился в программе позднее) :)
для этого всего лишь перепроведи документ "корректировка расчета с учредителем" ЗА ПРОШЛЫЙ ГОД.

удачи
:)

ммм. спасибо, пригодилось, а то я запарился искать этот документ. )