Есть ли в УТ или УТП стандартная возможность выдачи скидки разным контрагентам на разные группы товаров?
Какой варинат реализации Вы бы посоветовали?

Типовой.
Список получателей скидки

Список получателей скидки заполняется на закладке «Получатели скидки».

Вид получателей скидки зависит от установленного вида скидки:
Если вид скидки – розничная, то скидка назначается на определенный склад – оптовый, розничный или НТТ. Список складов заполняется в табличной части.
Если вид скидки – оптовая, то скидка назначается по договорам контрагентов. В качестве получателя скидки могут быть назначены только те договора контрагентов, для которых установлен вид договора – «С покупателем».

В том случае, если скидка назначается на все склады или по всем договорам контрагентов, то устанавливается флаг «Для всех получателей».

Список предоставленных скидок можно посмотреть в форме договора с контрагентом на закладке «Скидки договора».

Список позиций номенклатуры, для которых будет действовать скидка

Заполнить (Добавить) по группе – при таком варианте заполнения открывается дополнительное диалоговое окно, в котором можно задать одну или несколько групп товаров и ввести процент скидки и сумму ограничения по скидке. В табличную часть заполнятся товары указанной группы и введенный процент и ограничения по скидке. Используя режим добавления можно назначить различный процент и ограничение по товарам различных групп.

(1) а если договора С комиссионером этого сделать не получится штатно?