Нам абоненты платят по обязательствам, часто в одной платежке сумма задолженности, пени и госпошлина. Бухи бьют ее на три строки и указывают разные счета 62 долг, 76 например госпошлина и госпошлину указывают без НДС.
Договор оставляют тот же, так как у абонентов несколько договоров и на 76.02 например претензии хотят учитывать в разрезе договора.

Так вот не смотря на то, что указывается счет 76.02 и Без НДС, Регистрация счетов фактур на аванс пытается создать СФ на аванс на эти суммы. Таких сумм много, легко не уследить.

Какие выходы?
1. Дописывать обработку заполнения
2. Использовать другой тип договора (например прочее, что тоже очень не удобно), придется платежку физически делить на две, так как если вид в взаиморасчетов с покупателем то договор с видом прочее уже не выбрать.
Натолкните на мысль

3. или при проведении платежек не проводить 76 по определенным регистрам?

(1) какой вид операции?
а вообще 76ой счет проводится с видом прочее.
Проведение по регистрам зависит только от вида операции и никак не от счета