(3) При желании, на совсем низком уровне, можно и два файла с абсолютно одинаковыми именами создать в одной директории.
Только зачем?
По сабжу - подкрути процедуру обработки редактирования ТЧ документа. И будет тебе счастье.
Кстати одинаковые строки в ТЧ документа действительно бывают оправданны. Например два одинаковых топлива, но по разным доверенностям. 1с почему то считает что это неправильно. Ай, куча докруток после тех "гениев" нужна.