при желании все можно. но все должно проходить автоматически без изменения каких то идентификаторов и статусов.
если же вы хотите настроить обмен на другой базе вручную введя уже используемые идентификаторы. то тут обработка по изменению реквизитов пишутся на коленке. но лучше такого вообще не допускать. только в тестовом случае.
кстати в УТ свободы больше чем в БП...