Есть элемент формы Типа булево, который заполняется значением из реквизита справочника.
Как можно обратиться к элементу на форме, чтобы проверить его на истину/ложь и произвести после уже определенные манипуляции???

Обращайся к данным.

ну как? пример любой можно накинуть то?
Объект.Реквизит = .... или как?

ЭтаФорма.МойРеквизит = (для управляемых)
ЭтаФорма.ЭлементыФормы.МойРеквизит.Значение = (для обычных)

(0) сам элемент ничем не заполняется - он привязан к реквизиту, данные которого он отображает; вот к этому реквизиту тебе и надо обращаться

еще варик для обычных
ЭтаФорма.МойРеквизит = ...

ЭтаФорма.ЭлементыФормы.МойРеквизит.Значение = (для обычных)
будет работать только если имена элемента управления и реквизита совподают