Скорее всего загруженная конфигурация в конвертацию не соответствует той, для которой загружается конвертация (судя по тому, что загрузка конвертации не находит регистр сведений). Надо выгрузить и загрузить метаданные конфигураций заново, регистры сведений скорее всего не выгружались при экспорте метаданных
(8) Галка "Выгружать регистры сведений" стоит при выгрузке?
Чтобы обнаруживать ошибки, программист должен иметь ум, которому доставляет удовольствие находить изъяны там, где, казалось, царят красота и совершенство. Фредерик Брукс-младший