Как организовать вообще?
ПО идее нужено писать из как минимум двух документов, можно в одном обработчике, но это не суть. Будут ли работать стандартные методы контроля за целостностью ссылок, или надо писать все в ручную, перезаписывать удалять с помощью менеджера отбора? У меня в документах не будет указанно что этот регистр привязан к такому то документу, как такое настроить? Измерение со сылкой на документ со списочным типом, или можно сделать "подчинен регистратору", и реквизит регистратор программно заполнять?

регистр накопления без регистратора? ну точно

1с не даст сохранить регистр накопления без регистратора

(1) и (2) - вы реально поняли, что написано в (0)? о_О

(0) Т.е. хочешь создать РН без регистратора?

(0) Конечно можно. Создаешь подписку, указываешь в ее источнике свои документы и в процедуре-обработчике прописываешь механизм заполнения измерений/ресурсов/реквизитов.

"У меня в документах не будет указанно что этот регистр привязан к такому то документу" - а вот так нельзя! У каждого документ есть реквизит Движения и проводиться данный документ может только по указанным в нем регистрам!

"реквизит регистратор программно заполнять" - да, это обязательно, а еще Активность и Период.

"или можно сделать "подчинен регистратору"

Может имелось ввиду Регистр сведений?