Прикольная проблемка: у одного из пользователей в окошке запуска 1с при редактировании одной проблемной ссылки на конфигурацию (либо её удаление) одновременно пропадает сразу и несколько других ссылок на другие базы.
Отсюда вопрос: а где хранится список ссылок на конфигурации (которые видны в окошке запуска)  ?

в реестре, Компьютер\HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\1C\1Cv7\7.7\Titles

(1) Через реестр удалилось

7ка сохраняет список баз при закрытии лаунчера. Какой был состав баз при последнем закрытии лаунчера, такой и сохранится. То есть можно несколько раз запустить 7ку, в первом окне добавить базу во втором, нет. Потом закрыть сначала первое окно, потом, второе. При следующем запуске лаунчера базы в списке не будет

(0) Терминал ?

(4) Да

(5) права у терминальных юзеров д.б. на соотв.ветки реестра.

(6) нет. Это был глюк под админом. В т.ч. и консольно проявлялся. Какотйо полтереймт ), удаляешь одну проблемную ветку,а вместо неё удалялись другие

(7) Не обижай полтергейст. У него кроме твоей проблемы своих глюков хватает. Просто, что-то не учёл с правами.